Siirry pääsisältöön

Tekeekö genomitieto sen mitä se lupaa?

Tämän päivän Helsingin Sanomissa julkaistiin todella kattava ja hienon kriittinen artikkeli Finngen projektista (https://www.hs.fi/sunnuntai/art-2000006623764.html). Itse olen ollut epäileväinen hankkeen suhteen alusta asti, ja erityisesti siksi että genomidatan potentiaali sairauksien parantamisessa, eli lupaukset joilla Finngeniä markkinoidaan, on jo tähän mennessä osoitettu hyvin rajalliseksi. Onkin erityisen kummallista, että Finngen käyttää samaa retoriikkaa jota Yhdysvalloissa käytettiin 20 vuotta sitten genomitiedon autuaaksi 


Kuvakaappaus USA:n senaatin kuulemisraportista vuodelta 2001

tekevistä vaikutuksista,vaikka tämänhetkinen tutkimus on menossa jo täysin vastakkaiseen suuntaan. Viimeisten vuosien aikana on julkaistu suuri määrä erittäin laajoja ns. genomiproteomiikka-analyysejä eri taudeista, ja yhteenvetona näiden julkaisuiden lopputulema on ollut se miten vähän geenit loppujen lopuksi minkään taudin luonteesta kertovat. Esimerkiksi syövässä tietyn tyyppisten geneettisten muutosten korrelaatio syövän ilmiasuun loppujen lopuksi vaikuttaviin proteiineihin on vain noin 20-30% luokkaa. Eli jos genomista yritetään päätellä miten syöpäsolu toimii, osutaan useammin harhaan kuin oikeaan. Asia on tietenkin täysin eri tiettyjen harvinaisten monogeenisten tautien kohdalla, joissa tietty mutaatio määrittää käytännössä koko taudinkulun. Nämä kuitenkin ovat harvinaissairauksia, joilla hyvin vähän kansantaloudellista merkitystä. Eli vaikka potilaille ja heidän omaisilleen taudit toki erittäin valitettavia tragedioita, näiden esimerkkien käyttäminen tällaisen hankkeen kansanterveyden merkityksen perusteluna ontuu pahasti. Nobel-komitean jäsenenäkin toiminut molekyyligenetiikan professori Juha Kere ilmaisee myös HS:n artikkelissa genomitiedon merkityksen hyvin selkeästi ” Keren mukaan isoja lääkeyhtiöitä ei kiinnosta Suomen kansanterveys, vaan oman tuotekehityksensä tehostaminen. Kansanterveyden näkökulmasta kansalaisten genomien kerääminen on hyödytöntä, hän sanoo. Tehokkaampaa olisi Keren mukaan panna miljoonat esimerkiksi lasten ja nuorten psykiatrian tai vanhustenhuollon parantamiseen. Tai voisi perustaa äijäneuvoloita keski-ikäisille miehille, Kere ehdottaa

 

On toki selvää, että Finngen hankkeesta tulee olemaan jossain vaiheessa lääketieteellistä hyötyä, ja parhaimmillaan se voi todella täyttää joitakin siihen asetettuja taloudellisia ja mainehyötyjä.  Kuitenkin jos Suomessa olisi haluttu oikeasti tehdä jotain mullistavaa ja uutta, olisi jo pitkälti tyhjäksi kalutun genomitiedon louhimisen sijaan voitu hypätä suoraan tieteen eturintamaan. Esimerkkejä uusista alueista on muitakin, mutta esimerkiksi olisi voitu panostaa proteiinitason muutosten analyyseihin eri taudeissa. Tähän on maailmalla jo hyvin kehittyneet teknologiat olemassa, ja Suomessakin on erittäin hyvää alan osaamista ja laitekantaa. Kuitenkaan proteiinitason ymmärrys ei ole vielä sillä tasolla etteikö globaalin johtoaseman saavuttaminen olisi ollut mahdotonta. Aivan samalla tavalla kuin genomitiedon kohdalla, se todellinen Suomen uniikki kilpailuvaltti, eli kattavat potilastiedostot ja rekisterit, olisi luonut tällekin hankkeelle todellisen maailmanlaajuisen kilpailuvaltin. Se että Fingen tapauksessa päädyttiin lanseeraamaan uudelleen vanha ajatus genomin autuaaksitekevästä vaikutuksesta valitettavasti kuvaa laajemminkin Suomen tiedepolitiikan tasoa. Suomessa menestyvät hankkeet jotka saadaan markkinoitua ministeriöille mahdollisimman suurina tutkimushimmeleinä ilman että kukaan oikeasti kriittisesti kysyy, tai oikeastaan edes osaa ministeriöissä kysyä, onko hankkeen ympärille rakennettujen lupausten takana oikeasti villoja ja olemmeko hankkeessa oikeasti tekemässä jotain uutta. 

Kommentit

Tämän blogin suosituimmat tekstit

Tieteen yllätyksiä: miten CIP2A nousi yllättäen syöpätutkimuksen kuumaksi nimeksi

Tieteessä harva asia etenee suoraviivaisesti ja usein on nähty että vuosia tutkittu ilmiö paljastaa aivan uuden puolen  ja koko tarina kirjoitetaan uudelleen. Näin kävi tutkimusryhmällemme lempilapsemme, eli CIP2A:n kanssa. Tutkimusryhmämme on jos jostain, niin tunnettu siitä, että löysimme CIP2A:n, syöpää edistävän proteiinin, joka estää kasvuestäjä PP2A:ta 1 . Se oli sen identiteetti. Se oli myös se tarina, jota kiersin kertomassa konferensseissa vuodesta toiseen mutta tämä ei herättänyt suurtakaan yleistä kiinnostusta. Sitten tuli vuosi 2021. Ensin oma tutkimusryhmämme  2   ja heti sen jälkeen Dan Durocherin laboratorio Toronton yliopistosta 3  julkaisi että CIP2A:lla on toinen elämä ja vieläpä sellainen, joka osoittautui kriittiseksi tietynlaisten syöpäsolujen selviytymiselle. Kyse oli soluista, joissa BRCA-geenit ovat mutatoituneet. Nämä geenit liittyvät tietyn tyyppiseen DNA:n korjaukseen, ja kun ne eivät toimi, solut joutuvat pärjäämään vaihtoehtoisi...

Suomen Akatemian vapaasti haettavissa oleva Kipinä tutkimusrahoitus kaksinkertaistettava

Viime viikon lopulla oli mielenkiintoinen tiedevaikuttamisen mahdollisuus kun torstaina vietin 2,5 tuntia Puheenaihe podcastin ( open.spotify.com/show/4mzphUue58CGISjLR6eCfe ) Rami Kurimon vieraana aiheena julkinen tiederahoitus. Laitan linkin podcast jaksoon kun tulee ulos tammikuussa.   Perjantaina sitten oli vuorossa paneelikeskusteluun osallistuminen akateemikko Martti Koskenniemen ja professori Anu Koivusen  koolle kutsumassa tutkijaseminaarissa "Miten turvaamme akateemisen vapauden Suomessa?" jossa pohditttin akateemisen vapauden tilaa ja sen turvaamista Suomessa.  Näiden pohjalta olin pohtinutkin summeeraavani ajatukseni noista tilaisuuksista tänne blogiin, mutta sitten tulikin vielä sunnuntaina opetusministeri Adlercreutzin LinkedIN päivitys jossa hän  ihaili Singaporen menestystä, mutta mitä ilmeisimmin ei ollut tietoinen siitä miten juuri Singapore on malliesimerkki siitä miten tieteeseen ja tiederahoitukseen panostaminen nostaa maan kilpailu...

Ensimmäinen aamu sen jälkeen kun menetin tieteentekijänä lopullisesti uskoni Suomeen.

Eiliset uutiset  tieteen rahoituksesta leikkaamisesta  olivat henkisesti niin kylmä rätti vastoin kasvoja että ei ole oikeastaan väliä enää vaikka juuri nämä leikkaukset peruttaisiinkin. Ilman perhettä  muuttaisin   niiden seurauksena välittömästi  ulkomaille  tekemään tiedettä    enkä katsoisi hetkeäkään taakseni. Jos ainoa syy joka pitää professorit Suomessa on perhe, voidaan miettiä mille tämän maan tulevaisuus on rakennettu.    Omalla kohdallani tämä  tapahtuma  tulee pysyvästi muuttamaan sitä kuinka sitoutunut olen työhöni ja siihen miten työni kautta voisin mahdollisesti tukea yhteiskuntaa. Jos hallituksella on oikeus hallita maata täysin itsekkäiden tarkoitusperien  kautta, välittämättä lainkaan siitä onko päätökset yhteiskunnan etujen mukaisia, käytän tästä eteenpäin itsekin tätä oikeutta. Olen myös täysin menettänyt uskoni rakentavaan dialogiin tai siihen että hallitus kuuntelisi tieteentekijöiden näkemyksiä siitä...