Siirry pääsisältöön

Tekeekö genomitieto sen mitä se lupaa?

Tämän päivän Helsingin Sanomissa julkaistiin todella kattava ja hienon kriittinen artikkeli Finngen projektista (https://www.hs.fi/sunnuntai/art-2000006623764.html). Itse olen ollut epäileväinen hankkeen suhteen alusta asti, ja erityisesti siksi että genomidatan potentiaali sairauksien parantamisessa, eli lupaukset joilla Finngeniä markkinoidaan, on jo tähän mennessä osoitettu hyvin rajalliseksi. Onkin erityisen kummallista, että Finngen käyttää samaa retoriikkaa jota Yhdysvalloissa käytettiin 20 vuotta sitten genomitiedon autuaaksi 


Kuvakaappaus USA:n senaatin kuulemisraportista vuodelta 2001

tekevistä vaikutuksista,vaikka tämänhetkinen tutkimus on menossa jo täysin vastakkaiseen suuntaan. Viimeisten vuosien aikana on julkaistu suuri määrä erittäin laajoja ns. genomiproteomiikka-analyysejä eri taudeista, ja yhteenvetona näiden julkaisuiden lopputulema on ollut se miten vähän geenit loppujen lopuksi minkään taudin luonteesta kertovat. Esimerkiksi syövässä tietyn tyyppisten geneettisten muutosten korrelaatio syövän ilmiasuun loppujen lopuksi vaikuttaviin proteiineihin on vain noin 20-30% luokkaa. Eli jos genomista yritetään päätellä miten syöpäsolu toimii, osutaan useammin harhaan kuin oikeaan. Asia on tietenkin täysin eri tiettyjen harvinaisten monogeenisten tautien kohdalla, joissa tietty mutaatio määrittää käytännössä koko taudinkulun. Nämä kuitenkin ovat harvinaissairauksia, joilla hyvin vähän kansantaloudellista merkitystä. Eli vaikka potilaille ja heidän omaisilleen taudit toki erittäin valitettavia tragedioita, näiden esimerkkien käyttäminen tällaisen hankkeen kansanterveyden merkityksen perusteluna ontuu pahasti. Nobel-komitean jäsenenäkin toiminut molekyyligenetiikan professori Juha Kere ilmaisee myös HS:n artikkelissa genomitiedon merkityksen hyvin selkeästi ” Keren mukaan isoja lääkeyhtiöitä ei kiinnosta Suomen kansanterveys, vaan oman tuotekehityksensä tehostaminen. Kansanterveyden näkökulmasta kansalaisten genomien kerääminen on hyödytöntä, hän sanoo. Tehokkaampaa olisi Keren mukaan panna miljoonat esimerkiksi lasten ja nuorten psykiatrian tai vanhustenhuollon parantamiseen. Tai voisi perustaa äijäneuvoloita keski-ikäisille miehille, Kere ehdottaa

 

On toki selvää, että Finngen hankkeesta tulee olemaan jossain vaiheessa lääketieteellistä hyötyä, ja parhaimmillaan se voi todella täyttää joitakin siihen asetettuja taloudellisia ja mainehyötyjä.  Kuitenkin jos Suomessa olisi haluttu oikeasti tehdä jotain mullistavaa ja uutta, olisi jo pitkälti tyhjäksi kalutun genomitiedon louhimisen sijaan voitu hypätä suoraan tieteen eturintamaan. Esimerkkejä uusista alueista on muitakin, mutta esimerkiksi olisi voitu panostaa proteiinitason muutosten analyyseihin eri taudeissa. Tähän on maailmalla jo hyvin kehittyneet teknologiat olemassa, ja Suomessakin on erittäin hyvää alan osaamista ja laitekantaa. Kuitenkaan proteiinitason ymmärrys ei ole vielä sillä tasolla etteikö globaalin johtoaseman saavuttaminen olisi ollut mahdotonta. Aivan samalla tavalla kuin genomitiedon kohdalla, se todellinen Suomen uniikki kilpailuvaltti, eli kattavat potilastiedostot ja rekisterit, olisi luonut tällekin hankkeelle todellisen maailmanlaajuisen kilpailuvaltin. Se että Fingen tapauksessa päädyttiin lanseeraamaan uudelleen vanha ajatus genomin autuaaksitekevästä vaikutuksesta valitettavasti kuvaa laajemminkin Suomen tiedepolitiikan tasoa. Suomessa menestyvät hankkeet jotka saadaan markkinoitua ministeriöille mahdollisimman suurina tutkimushimmeleinä ilman että kukaan oikeasti kriittisesti kysyy, tai oikeastaan edes osaa ministeriöissä kysyä, onko hankkeen ympärille rakennettujen lupausten takana oikeasti villoja ja olemmeko hankkeessa oikeasti tekemässä jotain uutta. 

Kommentit

Tämän blogin suosituimmat tekstit

Suomen Akatemian vapaasti haettavissa oleva Kipinä tutkimusrahoitus kaksinkertaistettava

Viime viikon lopulla oli mielenkiintoinen tiedevaikuttamisen mahdollisuus kun torstaina vietin 2,5 tuntia Puheenaihe podcastin ( open.spotify.com/show/4mzphUue58CGISjLR6eCfe ) Rami Kurimon vieraana aiheena julkinen tiederahoitus. Laitan linkin podcast jaksoon kun tulee ulos tammikuussa.   Perjantaina sitten oli vuorossa paneelikeskusteluun osallistuminen akateemikko Martti Koskenniemen ja professori Anu Koivusen  koolle kutsumassa tutkijaseminaarissa "Miten turvaamme akateemisen vapauden Suomessa?" jossa pohditttin akateemisen vapauden tilaa ja sen turvaamista Suomessa.  Näiden pohjalta olin pohtinutkin summeeraavani ajatukseni noista tilaisuuksista tänne blogiin, mutta sitten tulikin vielä sunnuntaina opetusministeri Adlercreutzin LinkedIN päivitys jossa hän  ihaili Singaporen menestystä, mutta mitä ilmeisimmin ei ollut tietoinen siitä miten juuri Singapore on malliesimerkki siitä miten tieteeseen ja tiederahoitukseen panostaminen nostaa maan kilpailu...

Kasvuriihiryhmän terveiset tieteelle ja tutkimukselle

Se on varmasti tullut kaikille selväksi, että Suomi tarvitsee kasvua. Kun sitä ei ole näkynyt vuosiin eikä tämänhetkiset politiikan toimetkaan sitä näytä tuovan, on korkeat odotukset asetettu  Orpon hallituksen asettaman ja Risto Murron vetämän Kasvuriihi-hankkeen tuloksilla. Työryhmä luovutti raporttinsa tänään ja se on luettavissa täältä:  http://urn.fi/URN:ISBN:978-952-383-710-2   Tiede edellä palstan seuraajille ei luulisi tulevan yllätyksenä että olen itse näkökantanani  Kasvuriihi-hankkeeseen painottanut yliopistojen ja tutkijalähtöisen tiederahoituksen tukemisen tärkeyttä kaiken kasvun pohjana ( linkki ). Alla pikaluvulla läpikäydystä raportista tärkeimmät huomiot koskien tiedettä ja tutkimusta    Ehdottomasti positiivista on että yksi kasvutoimenpiteistä on Korkeakoulujen tutkimus ja kehitystoiminnan rahoituksen vahvistaminen (toimenpide 2.5). Itse ehdotuksessa todetaan että julkista tukea on perustellumpaa suunnata perustutkimukseen, sove...

Miksi kirjallisuuspalkinto on kiinnostavampi kuin tiedepalkinto ?

  Kuukausi sitten jaettiin Suomen parhaalle biolääketieteen julkaisulle vuosittain jaettava Medix-palkinto. Sen sai professori Eero Castrenin johtama työryhmä Cell-julkaisusarjan julkaisustaan, joka osoitti uuden toimintamekanismin satojen miljoonien ihmisten käyttämälle masennuslääkkeelle. Ajattelin että tässäpä vasta tiedeuutinen, joka varmasti tullaan julkaisemaan laajalti tärkeimmissä tiedotusvälineissä. Odottelin muutamia päiviä ja tein sitten haun Ylen, Helsingin Sanomien, ja MTV3 uutissivustoilla ja ainoa joka aiheeseen oli tarttunut, oli MTV3, joka julkaisi palkinnosta kahdeksan rivin maininnan nettisivuillaan.   Julkisilla palkinnoilla osoitetaan yhteiskunnan arvostusta palkinnon saajan toimintaa kohtaan. Tiedebarometrin mukaan, noin 2/3 Suomalaisista on kiinnostunut tieteestä ja luottaa tieteen ratkaisevan merkittäviä yhteiskunnallisia ongelmia. Tämän perusteella kuvittelisi tiedesaavutuksia huomioivien palkintojen kiinnostavan kansalaisia. Palkintojen saaman julkise...